Jonas não veste a camisa rubro-negra desde 2015, ano em que foi contratado. O volante teve poucas chances no clube e foi emprestado pela primeira vez em 2016, para a Ponte Preta. Sem oportunidades na Macaca, o jogador foi novamente repassado a outra equipe – dessa vez ao Dínamo Zagreb, da Croácia.
Em 2017, o volante voltou ao Brasil para vestir a camisa do Coritiba, que foi rebaixado para a Série B. O Flamengo ainda não se pronunciou sobre a intenção de manter ou fazer um novo empréstimo de Jonas, que tem contrato com o clube até 2019, segundo o Lance!.
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