O atleta chegou ao Flamengo no ano de 1996, vindo do Palmeiras. O técnico do Alviverde, Vanderlei Luxemburgo, liberou o jogador para assinar com o Fla e logo caiu nas graças da torcida. O volante contava com muita raça e virou xodó dos adeptos. Desse modo, ficou marcado com alguns títulos como a Copa de Ouro, conquistado de forma invicta e dentro do Maracanã. O adversário da final foi o São Paulo, e o jogo terminou 3 a 1 para o Mengo.
Nesse período no clube, Mancuso atuou ao lado de grandes nomes como Athirson, Sávio, Fábio Baiano, Nélio, entre outros. Vale destacar que foi justamente nesse ano que o zagueiro Juan chegou aos profissionais do time. O atleta é considerado um dos maiores ídolos da história do Fla.